Niittyviljelyllä on merkittävä vaikutus luonnon monimuotoisuuteen. Tällä hetkellä niityt ovat kuitenkin Euroopan uhanalaisimpia biotooppeja, ja niillä kasvaa enää noin kuusi miljoonaa puuta.
Niittyviljelmät tarjoavat ideaalisen ja ravinteikkaan elinympäristön monille linnuille, hiirille, siileille, kovakuoriaisille, uhanalaisille hyönteisille, perhosille, mehiläisille, ampiaisille ja muille hyönteisille. Euroopan niittyviljelmiltä löytyykin yli 5000 eläin- ja kasvilajia sekä yli 3000 hedelmälajia.